MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 5333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007412	GCTG	2	8	257294	257301	0 %	25 %	50 %	25 %	75812880
4502	NC_007412	TGA	2	6	257306	257311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
4503	NC_007412	GGCTG	2	10	257358	257367	0 %	20 %	60 %	20 %	75812880
4504	NC_007412	CAG	2	6	257389	257394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4505	NC_007412	CCTA	2	8	257436	257443	25 %	25 %	0 %	50 %	75812880
4506	NC_007412	AAT	2	6	257489	257494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812880
4507	NC_007412	TTG	2	6	257586	257591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812880
4508	NC_007412	TGT	2	6	257617	257622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812880
4509	NC_007412	TGC	2	6	257635	257640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4510	NC_007412	TCT	2	6	257667	257672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812880
4511	NC_007412	TG	3	6	257701	257706	0 %	50 %	50 %	0 %	75812880
4512	NC_007412	TGC	2	6	257743	257748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4513	NC_007412	CTA	2	6	257773	257778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812880
4514	NC_007412	A	6	6	257792	257797	100 %	0 %	0 %	0 %	75812880
4515	NC_007412	TTG	2	6	257799	257804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812880
4516	NC_007412	CTG	2	6	257877	257882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4517	NC_007412	TTA	2	6	257922	257927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812880
4518	NC_007412	TGC	2	6	257936	257941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4519	NC_007412	GCC	2	6	258029	258034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812880
4520	NC_007412	GAT	2	6	258036	258041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
4521	NC_007412	ATG	2	6	258172	258177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
4522	NC_007412	GTA	2	6	258268	258273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
4523	NC_007412	GTT	2	6	258332	258337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812880
4524	NC_007412	GGT	2	6	258503	258508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812880
4525	NC_007412	AGC	2	6	258518	258523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4526	NC_007412	AGC	2	6	258614	258619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4527	NC_007412	GAA	2	6	258717	258722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812880
4528	NC_007412	AAC	2	6	258779	258784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812880
4529	NC_007412	GTC	2	6	258895	258900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4530	NC_007412	GGT	2	6	258914	258919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812880
4531	NC_007412	GCCA	2	8	258975	258982	25 %	0 %	25 %	50 %	75812880
4532	NC_007412	CCAA	2	8	258991	258998	50 %	0 %	0 %	50 %	75812880
4533	NC_007412	AGA	2	6	259025	259030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812880
4534	NC_007412	TTA	2	6	259035	259040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812880
4535	NC_007412	TGG	2	6	259054	259059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812880
4536	NC_007412	TGGT	2	8	259125	259132	0 %	50 %	50 %	0 %	75812880
4537	NC_007412	TA	3	6	259262	259267	50 %	50 %	0 %	0 %	75812880
4538	NC_007412	TGA	3	9	259340	259348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
4539	NC_007412	GCG	2	6	259422	259427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812880
4540	NC_007412	T	6	6	259428	259433	0 %	100 %	0 %	0 %	75812880
4541	NC_007412	GAAG	2	8	259434	259441	50 %	0 %	50 %	0 %	75812880
4542	NC_007412	TAA	2	6	259442	259447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812880
4543	NC_007412	AGC	2	6	259450	259455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4544	NC_007412	GAGAG	2	10	259456	259465	40 %	0 %	60 %	0 %	75812880
4545	NC_007412	GGA	2	6	259529	259534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812880
4546	NC_007412	TAG	2	6	259541	259546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
4547	NC_007412	ATT	2	6	259569	259574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812880
4548	NC_007412	TCC	2	6	259649	259654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812880
4549	NC_007412	TGT	2	6	259715	259720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812880
4550	NC_007412	CGT	2	6	259767	259772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4551	NC_007412	TAG	2	6	259810	259815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
4552	NC_007412	AGT	2	6	259848	259853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
4553	NC_007412	AT	3	6	259862	259867	50 %	50 %	0 %	0 %	75812880
4554	NC_007412	AGC	2	6	259925	259930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4555	NC_007412	AGT	3	9	259931	259939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
4556	NC_007412	TA	3	6	259976	259981	50 %	50 %	0 %	0 %	75812880
4557	NC_007412	GTT	2	6	260057	260062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812880
4558	NC_007412	TGA	2	6	260120	260125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
4559	NC_007412	ACG	2	6	260131	260136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4560	NC_007412	GAA	2	6	260182	260187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812880
4561	NC_007412	TCG	2	6	260252	260257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4562	NC_007412	TTG	2	6	260323	260328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812880
4563	NC_007412	GGT	2	6	260383	260388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812880
4564	NC_007412	AGC	2	6	260408	260413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4565	NC_007412	CAG	2	6	260479	260484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4566	NC_007412	TGT	2	6	260501	260506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812880
4567	NC_007412	T	6	6	260506	260511	0 %	100 %	0 %	0 %	75812880
4568	NC_007412	TCA	2	6	260547	260552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812880
4569	NC_007412	CT	3	6	260557	260562	0 %	50 %	0 %	50 %	75812880
4570	NC_007412	T	6	6	260594	260599	0 %	100 %	0 %	0 %	75812880
4571	NC_007412	ATC	2	6	260603	260608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812880
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4573	NC_007412	CCTTCC	2	12	260653	260664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812880
4574	NC_007412	TAC	2	6	260712	260717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812880
4575	NC_007412	CGC	2	6	260726	260731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812880
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4578	NC_007412	CGC	2	6	260831	260836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812880
4579	NC_007412	ACG	2	6	260908	260913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4580	NC_007412	GAA	3	9	260925	260933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812880
4581	NC_007412	GAC	2	6	260944	260949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
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4583	NC_007412	AGA	2	6	260981	260986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812880
4584	NC_007412	ATG	2	6	260992	260997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812880
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4586	NC_007412	CGG	2	6	261053	261058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812880
4587	NC_007412	AGC	2	6	261062	261067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812880
4588	NC_007412	CTA	2	6	261091	261096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812880
4589	NC_007412	A	7	7	261099	261105	100 %	0 %	0 %	0 %	75812880
4590	NC_007412	AACCAA	2	12	261107	261118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812880
4591	NC_007412	AAT	2	6	261146	261151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812880
4592	NC_007412	A	6	6	261212	261217	100 %	0 %	0 %	0 %	75812881
4593	NC_007412	TCT	2	6	261224	261229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812881
4594	NC_007412	ATT	2	6	261272	261277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812881
4595	NC_007412	CGC	2	6	261328	261333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812881
4596	NC_007412	GA	3	6	261507	261512	50 %	0 %	50 %	0 %	75812881
4597	NC_007412	CCT	2	6	261530	261535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812881
4598	NC_007412	TGC	2	6	261592	261597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812881
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4601	NC_007412	ACAGA	2	10	261695	261704	60 %	0 %	20 %	20 %	75812881
4602	NC_007412	AGA	2	6	261727	261732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812881
4603	NC_007412	AGA	2	6	261757	261762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812881
4604	NC_007412	GA	3	6	261924	261929	50 %	0 %	50 %	0 %	75812881
4605	NC_007412	ACG	2	6	261969	261974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812881
4606	NC_007412	CGG	2	6	262006	262011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812881
4607	NC_007412	TGAT	2	8	262077	262084	25 %	50 %	25 %	0 %	75812881
4608	NC_007412	AATTG	2	10	262087	262096	40 %	40 %	20 %	0 %	75812881
4609	NC_007412	CCA	2	6	262106	262111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812881
4610	NC_007412	AAT	2	6	262154	262159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812881
4611	NC_007412	TAT	2	6	262165	262170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812881
4612	NC_007412	AT	3	6	262213	262218	50 %	50 %	0 %	0 %	75812881
4613	NC_007412	ATT	2	6	262317	262322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812882
4614	NC_007412	ACT	2	6	262358	262363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812882
4615	NC_007412	AG	3	6	262461	262466	50 %	0 %	50 %	0 %	75812882
4616	NC_007412	CAA	2	6	262479	262484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812882
4617	NC_007412	TAT	2	6	262487	262492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812882
4618	NC_007412	CTA	2	6	262522	262527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812882
4619	NC_007412	TG	3	6	262578	262583	0 %	50 %	50 %	0 %	75812882
4620	NC_007412	ATT	2	6	262588	262593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812882
4621	NC_007412	TAA	2	6	262594	262599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812882
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4623	NC_007412	GAA	2	6	262716	262721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812882
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4872	NC_007412	AAT	2	6	276075	276080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812890
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4995	NC_007412	ACT	2	6	281820	281825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812891
4996	NC_007412	T	6	6	281825	281830	0 %	100 %	0 %	0 %	75812891
4997	NC_007412	CTG	2	6	281874	281879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812891
4998	NC_007412	TAA	2	6	281882	281887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812891
4999	NC_007412	CCT	2	6	281929	281934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812891
5000	NC_007412	TTC	2	6	281979	281984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812891

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